Der San Marino GP sollte für Thomas ein Desaster werden. In der Quali kam er nur auf den 14. Platz und da es zu Rennbeginn regnete, rutschte er mit einem schlechten Start sogar auf P16 zurück. Hier konnte er sich nur mit Hängen und Würgen halten, doch zum Glück wurde der Regen weniger, hörte schließlich auf und die Strecke trockenete ab. Thomas ging als einer der ersten Pitten und war damit genau zum richtigen Zeitpunkt auf Slicks.
Er schaffte es sich auf P8 im bereinigten Feld vor zu fahren, doch er hatte weiterhin starke Probleme mit dem Handling des Jordan. Schließlich sollten von hinten mehrere Fahrer aufschließen und Thomas noch bis auf P12 durch reichen. Damit war es wieder ein Wochenende zum Vergessen und Thomas hat keine Ahnung, warum es aktuell nicht läuft.
Schumacher siegte unterdessen vor Hill, Herbert, Coulthard, Berger und Frentzen. In der Meisterschaft hat Schumacher damit um 5 Punkte die Führung vor Herbert, Hill und Coulthard übernommen, Thomas ist weiterhin auf dem siebten Platz. Da McLaren in dieser Saison noch nicht punkten konnte, ist Jordan immerhin vierter der Konstrukteure hinter Benetton, Williams und Ferrari.
